在anaconda安装emmax

安装anaconda发行版中所有的包:.windows和mac系统下anaconda安装.

下载地址:https://www.anaconda.com/download/.Anaconda对于python初学者而言及其友好,相比单独安装python主程序,选择Anaconda可以帮助省去很多麻烦,Anaconda里添加了许多常用的功能包,如果单独安装python,这些功能包则需要一条一条自行安装,在Anaconda中则不需要考虑这.

https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/.conda 是一个开源的包、环境管理器,可以用于在同一个机器上安装不同版本的软件包

5.升级安装包:rpm -Uvh 包全名 所有已经安装的包都在/var/lib/rpm/资料库中.6.rpm -e 包名 卸载已经安装的软件包.

conda update conda conda update anaconda conda update anaconda-navigator update最新版本的anaconda-navigator .个人认为最好的Python开源版本,能非常有效的解决Python包在不同平台下的安装障碍(当然优势不仅这一句了,大家可自行百度)

今天要介绍 GWAS_Flow (https://github.com/Joyvalley/GWAS_Flow)这个工具,它是基于 TensorFlow 的 GWAS 框架,使用的是 EMMAX 方法。 安装 GWAS_Flow 可以基于Git和 Anaconda 安装。它虽然也有 Docker 和 Singularity 版,但目前还在开发,可能会有些障碍,不建议使用。 输入资料 GWAS_Flow 至少需要一个基因型文件和表型文件,如果有 kinship matrix、协变量等,也可加进去。如果没有提供 kinship matrix,GWAS_Flow 会自动使用 van Raden 的方法计算 kinship。 可以接受 HDF5 、CSV 和 Plink(bed/bim/fam) 三种格式。其中,CSV格式是基因型编码为 0,1,2 的 csv 文件,第一行为

版权GitCode 开源社区文章已被社区收录conda,anaconda,miniconda傻傻分得清楚.Conda是一个开源的包管理系统和环境管理系统,可以用于安装、管理和卸载软件包以及创建和管理虚拟环境。.Anaconda提供了一种快速、简单、可靠的方法来安装和管理资料科学工具和库。.

1、首先考虑的是访问Anaconda官网的macOS下载地址:https://www.anaconda.com/products/distributionmacos,如图所示.前面我们已经完成了Python环境的安装和配置,这里给大家推荐安装Anaconda,由于此安装Anaconda之后,我们不仅拥有了Python环境,而且Anaconda还自带Jupyter Notebook集成环境,可以很方便的帮助我们学习.

samtools, gatk4, bcftools, vcftools, sratools, seqtk, seqkit,fastp, fastq, fastqc, trimmomatic, freebays, bwa, eggnog-mapper, trf, blast, mafft, muscle, clustalw, circle, delly, gcta, tassel, gemma, emmax, hmmer, java-jdk, perl, pip, tk, wget, unzip, canu, plink, python.创建好的虚拟环境可以在Miniaconda安装目录envs文件下找到。 激活环境 关闭虚拟环境,回到base环境下 删除虚拟环境 安装包,在部分包安装不上时 conda 和pip可以切换使用,操作和python安

(1)在官网(www.anaconda.com)上下载 anaconda 个人版:根据自己的需求选择不同的版本下载,本次选择的是 Python 3.7 版本,以下安装步骤基于该版本进行操作(2)国内镜像站下载 anaconda:清华大学开源软件镜像站中下载 anaconda,根据自己电脑的情况选择安装包(x32 or x64).